Regionální rozvojová agentura jižní Moravy je zájmovým sdružením právnických osob. Členy sdružení jsou Jihomoravský kraj, Euroregion Pomoraví a Krajská hospodářská komora jižní Moravy; zástupci těchto organizací tvoří řídící orgány RRAJM.
Nejvyšším orgánem RRAJM je Valné shromáždění, které rozhoduje o strategických plánech a cílech RRAJM, schvaluje rozpočet a rozhoduje v dalších otázkách dle stanov sdružení.
Jihomoravský kraj
Mgr. Jan Grolich (hejtman Jihomoravského kraje)
Euroregion Pomoraví
Ing. Jan Zámečník (předseda Správní rady Euroregionu Pomoraví)
Krajská hospodářská komora jižní Moravy
Ing. Michal Štefl (předseda Krajské hospodářské komory jižní Moravy)
Správní výbor je výkonným orgánem sdružení, které realizuje do praxe usnesení Valného shromáždění. Správní výbor má dle stanov patnáct členů volených Valným shromážděním. Každý člen sdružení má ve Správním výboru po pěti zástupcích.
Jihomoravský kraj
Radomír Pavlíček (předseda Správního výboru)
Jiří Kadeřávek
Mgr. Jiří Nantl, LL.M.
Marie Kousalová
Mgr. Žaneta Kozubíková
Euroregion Pomoraví
Ing. Lubomír Šmíd
Simona Mašová
Mgr. Antonín Okénka
Bc. Svatopluk Pěček
Mgr. Jaroslav Suchý
Krajská hospodářská komora jižní Moravy
Ing. Luděk Šebesta (místopředseda Správního výboru)
Ing. Jan Mega
Ing. Karel Břenek
Ing. Luboš Kukliš
Ivo Lizna
Kontrolní komise dohlíží na výkon působnosti Správního výboru a na uskutečňování činnosti sdružení v souladu s předmětem jeho činnosti. Kontrolní komise se dle stanov skládá z šesti členů, kteří jsou voleni Valným shromážděním. Každý člen sdružení má v Kontrolní komisi po dvou zástupcích.
Jihomoravský kraj
Ing. Roman Celý
František Novotný
Euroregion Pomoraví
Mgr. Petr Kostík (předseda Kontrolní komise)
Daniel Čmelík
Krajská hospodářská komora jižní Moravy
Mgr. Ing. Milan Šouba (místopředseda Kontrolní komise)
Mgr. Ludmila Nolčová